稻田甲烷测定要求具备该领域背景的专家，至少是经过专家（如研究机构）培训的专门人员来实施。本指南不能取代专家的现场指导。专家至少应提出应用本方法学的项目的甲烷测定标准情况。
项目参与方要在生长季开始前制定详细的甲烷排放季节测定计划。计划要包括 田间和实验室测定时间安排，要统筹安排以方便获取实验室和耕作日志。此计划同时还要包括参照稻田的详细信息，如特定位置、气候、土壤、水分管理、 施肥管理以及有机肥施用等。
下列指南依据从田间观测到排放因子计算的步骤而制定。项目倡导者要确保采用相同方法并同时对项目和参照农田进行观测。
田间观测–箱法设计技术选项
| 特性 | 条件 | |
| 箱体材料 | 选项 1: 不透明材料 1、商用 PVC 容器或加工制品（如电镀金属）； 2、喷白漆或外敷反光材料（防止内部升温过快）； 3、只限于短时间使用（一般 30 分钟）； | 选项 2: 透明材料 1、有机玻璃； 2、透明箱的优点：如果配备顶盖，在观测和闲置时分别可关闭和打开，透明箱可长时间放置于田间 |
| 测定箱在稻田中的放置 | 选项 1: 固定底座 1、利用耐腐蚀材料制成的底座可整个生长季放置于田间； 2、底座应满足严格的箱体密封条件； 3、底座下端插入土壤的部分要设有小孔，以保证内外水分交流； 4、至少早于首次取样前 24 小时将底座安置于田间 | 选项 2: 无底座 该种箱体直接插入土壤中，要有可开启的顶盖以保证释放气泡中甲烷和测量的准确性。 |
| 箱体附属装置 | 温度计：测量箱内温度； 电扇：取样期间混合箱内空气（干电池供电）； 取样口：箱体小口处安置橡胶塞以取样 | |
| 底面积 | 长方形或圆形，最小面积要覆盖四蔸水稻 （最小大于 0.1 m²） | |
| 高度 | 选项 1: 固定高度 总高度要超过植株高度（底座突起部分加箱体） | 选项 2: 可调节高度 根据作物生长调节箱体高度； 箱体设计不同高度或组合； |
| 每个区组箱体重复数 | 最低要求：每个小区 3 个重复 | |
| 每次箱体密闭后取样次数 | 最低要求：3 次 | |
| 密闭时间 | 30 分钟 | |
| 取样时间 | 上午 | |
| 取样间隔 | 最低要求：每周 1 次 | |
| 注射器 | 取样前进行检漏等工作 最好装配三通阀以方便操作 | |
| 待测样品保存时限 | 小于 24 小时：可持续使用注射器保存； 大于 24 小时：将样品转移至真空瓶，以轻度高压保存 | |
| 方法 | 配备氢火焰离子化检测器（FID）的气相色谱 | |
| 进样 | 直接进样或阀进样 | |
| 分析柱 | 填充柱（分子筛等）或毛细柱 | |
| 校正 | 每天分析前后用有资质的标准气体校正 |
计算区组排放速率（参照农田）
1、利用下列公式计算每个气体分析的甲烷排放：
其中：
mCH4,t t 时间箱内 CH4质量（mg）
t 取样时间点（如 30 分钟内 3 次取样的 0 分钟, 15 分钟和 30 分钟）
cCH4,t t 时间箱内 CH4 浓度（ppm）
VChamber 密闭性体积（L）
MCH4 CH4摩尔质量：16 g/mol
1atm 在未装气压计情况下，假设气压无变化，采用 1 标准大气压
R 通用气体常数：0.08206 L atm K-1 mol-1
Tt t 时间箱内温度（K）
2、通过相关软件（如 Excel）确定 MCH4 的最佳拟合曲线：
其中：
s 最佳拟合曲线的斜率 （mg/min）
3、计算每次箱法观测的甲烷排放速率：
其中：
REch 密闭箱 ch 的甲烷排放速率（mg/h * m²）
ch 同一区组重复箱体编号索引
AChamber 密闭箱底面积（m²）
4.、每一区组甲烷平均排放速率的计算：
其中：
REplot 每一区组平均排放速率 （mg/h * m²）
Ch 该区组内密闭箱重复数
其它步骤：从每次观测计算的区组平均排放速率，将其积分计算整个生长季排放因子。最简单的方法是将排放速率乘以每次观测间隔的时间。将单位 mg/m² 乘以 0.01 以换算为 kg/ha。
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